Salute
Tokyo: nuovo studio sui genomi delle mutazioni del Covid-19
SARS-CoV-2 è il virus responsabile della pandemia di Covid-19. Sappiamo che si sono verificate e si sono diffuse mutazioni nel genoma della SARS-CoV-2, ma che effetto hanno queste mutazioni? Gli attuali metodi per studiare le mutazioni nel genoma della SARS-CoV-2 sono molto complicati e dispendiosi in termini di tempo, perché i coronavirus hanno genomi di grandi dimensioni, ma ora un team dell’Università di Osaka e dell’Università di Hokkaido hanno sviluppato un sistema di genetica inversa rapido basato su PCR per analizzare le mutazioni SARS-CoV-2.
Questo sistema utilizza la reazione a catena della polimerasi (PCR) e una reazione di estensione circolare della polimerasi (CPER) per ricostruire il cDNA a tutta lunghezza del genoma virale. Questo processo non comporta l’uso di batteri, che possono introdurre ulteriori mutazioni indesiderate, e richiede solo due settimane utilizzando semplici passaggi per generare particelle di virus infettive. I metodi precedenti hanno richiesto un paio di mesi ed erano procedure molto complicate.
“Questo metodo ci consente di esaminare rapidamente le caratteristiche biologiche delle mutazioni nella SARS-CoV-2“, afferma l’autore principale dello studio Shiho Torii. “Possiamo utilizzare la tecnica CPER per creare virus ricombinanti con ogni mutazione ed esaminarne le caratteristiche biologiche rispetto al virus parentale.” Il grande genoma circolare del SARS-CoV-2 può essere costruito da frammenti di DNA più piccoli che possono quindi essere fatti in un genoma virale vitale con CPER, e utilizzati per infettare cellule ospiti adatte. Una grande quantità di particelle virali infettive può essere recuperata nove giorni dopo.
“Crediamo che il nostro metodo CPER contribuirà alla comprensione dei meccanismi alla base della propagazione e della patogenesi della SARS-CoV-2, oltre a contribuire a determinare il significato biologico delle mutazioni emergenti”, spiega l’autore corrispondente Yoshiharu Matsuura. “Ciò potrebbe accelerare lo sviluppo di nuove terapie e misure preventive per il Covid-19.” Il team suggerisce anche che l’uso del metodo CPER consentirà ai ricercatori di inserire “geni reporter” nel genoma SARS-CoV-2 per “taggare” geni o proteine di interesse. Ciò consentirà una maggiore comprensione di come la SARS-CoV-2 infetta le cellule e causa Covid-19, assistendo nello sviluppo di terapie. Il metodo CPER potrebbe anche consentire la produzione di un virus ricombinante che non è in grado di causare la produzione di malattie, che potrebbe essere utilizzato come vaccino sicuro ed efficace per la SARS-CoV-2.
Mutazioni stanno emergendo nella popolazione SARS-CoV-2 costantemente, così come legittimi dubbi su cosa fanno tali mutazioni e se potrebbero influenzare l’efficacia dei vaccini. “Il nostro metodo semplice e rapido consente agli scienziati di tutto il mondo di caratterizzare i mutanti, che è un passo avanti vitale nella nostra lotta contro la SARS-CoV-2”, afferma Takasuke Fukuhara del gruppo di ricerca.
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