Tecnologia
L’innovativa App Genopo che studia il genoma del Coronavirus
Alcuni sviluppatori hanno realizzato un’app in grado di analizzare il genoma del coronavirus in un lasso di tempo davvero breve: meno di mezz’ora. Questa applicazione, di nome Genopo, sviluppata dal Garvan Institute of Medical Research, in collaborazione con l’Università di Peradeniya in Sri Lanka consente a chi ha poche risorse, come gli studiosi che si trovano nelle regioni più povere, di accedere alla genomica.
Non tutti, infatti, possono avere accesso alle risorse necessarie e abbastanza potenti per analizzare il DNA e l’RNA, ma tutti hanno la possibilità di utilizzare uno smartphone. Il co-autore senior Dr Ira Deveson, che dirige il Genomic Technologies Group presso il Garvan’s Kinghorn Center per la genomica clinica, ha infatti spiegato: “L’analisi genomica rapida e in tempo reale è oggi più cruciale che mai, come metodo centrale per monitorare la diffusione del coronavirus. La nostra app rende l’analisi genomica più accessibile, mettendo letteralmente la tecnologia nelle tasche degli scienziati di tutto il mondo“.
L’applicazione apre nuove prospettive per l’analisi rapida
Attualmente, le tecnologie impiegate nell’analisi genomica sono molto potenti, i ricercatori si avvalgono di computer server di fascia alta, e lo scopo degli studiosi è quello di ribaltare tale situazione, attraverso la “miniaturizzazione” degli strumenti bioinformatici in grado di essere utilizzati anche su un dispositivo Android di utilizzo comune.
Gli scienziati hanno utilizzato questa innovativa app su alcuni dati grezzi di sequenziamento di campioni di virus isolati appartenenti a nove pazienti di Sydney affetti da SARS-CoV-2, e hanno analizzato i dati testando la loro app su diversi dispositivi Android, di diversi modelli con differenti marchi, tra cui Nokia, Huawei, LG e Sony. L’innovativa applicazione, Genopo, ha impiegato circa 27 minuti per determinare la sequenza completa del genoma di SARS-CoV-2 partendo dai dati grezzi dei pazienti. Secondo gli studiosi, questo lasso di tempo così breve illustra la possibilità di effettuare delle analisi genomiche quasi in tempo reale.
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